第285章 这还是化学问题吗(4/5)
人工酶。
感受著徐铭语气中散发出的自信和胸有成竹,周启深也不由得松了口气。
身上自己给自己的压力,顿时减轻许多。
「看来今晚我是来对了,真让人期待啊!」周启深脸上堆出灿烂笑容。
翌日。
徐铭同全体议题组员,接入超算中心会议室,把初步设计方案序列,输入到模型的快速评估模块。
「序列正在输入。」
「筛选标准为,折叠自由能低于-8.0千卡每摩尔,金属簇结合能预测值低于-12.0,底物结合通道在分子模拟中至少保持开放10纳秒。」
「计算开始。」
房间内两地同步播报声音响起,两千个设计被转化为数学模型。
在数字宇宙中经历严酷的演化压力。
有些序列理论上根本无法折叠;有些能折叠,但形成的口袋形状偏离要求;有些虽能结合金属簇,但静电梯度完全错误。
伴随著一个个设计被筛选出局,留下可行性最高的极少部分方案。
整个快速筛选共持续了十二个小时。
众人一直待到了晚上九点,终于拿到筛选结果。
「徐院。」
「根据报告显示,在所有设计中,有13个在100纳秒模拟中保持了结构完整性。」
「金属簇稳定结合,底物通道保持开放。」
路川强忍著心中剧烈的情绪波动,当著全体组员的面向徐铭汇报,关于超级计算机对设计的筛选结果。
在这13个通过筛选的设计中,很有可能就存在,实现酶催化所需的全新蛋白质结构。
关键仅用了半个多月时间,就走到了这一步,放到以前他参与项目时,可以说连想都不敢想。
偏偏徐铭将其变成了现实。
当然他非常清楚,之所以能快速筛选,要归功于徐铭除数学和化学之外的信息算法水平,否则换成别人想把这些设计从两千筛选到十几个,花费几年时间在数学界都是件很正常不过的事情。
甚至最终还得不到一个好的结果。
对于这份报告,周启深同样喜不胜收,下秒接过报告激动的搭话。
「可以开始合成了。」
「十三个序列,依次做密码子优化,合成基因,构建表达载体。」
然就在他话音落下的同时,却见位于主座的徐铭摇了摇头提出不同意见。
「还是太慢了,要做二轮筛选。」
「二轮筛选?」周启深眼神中流露出惊讶。
在他看来只是对十三个设计合成,所需花费的时间和实验次数是能够接受的,只



